앞서 String.intern() 메소드를 사용하면 Perm 영역에서 GC가 많이 발생할 수 있다고 했다. 
http://tuning-java.com/455 참고.
그런데, 이 글을 읽는 분들은 대부분 아시겠지만, Perm 영역에는 클래스와 메소드등의 정보가 들어가게 된다. 많은 클래스를 읽어들일 수록 Perm 영역은 당연히 부족해지고, Full GC를 발생시킬 수 있다. 

이런 문제를 발생시키는 주된 원인은 Reflection을 사용해서 메소드 호출등을 할 경우도 포함된다.

왜 Perm 영역에서 Full GC가 발생할 수 있는지에 대한 설명이 잘 되어 있는 문서다. 
http://anshuiitk.blogspot.com/2010/11/excessive-full-garbage-collection.html

 관심 있는 분들은 한번 정도 읽어 보면 좋을 듯 하다. 

그리고, 
http://coding.derkeiler.com/Archive/Java/comp.lang.java.programmer/2006-11/msg00122.html
이 글도 보면 도움이 될 것이다. 
 
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